年是不平凡的一年，在这一年里小鹿发生了很多大事件
鹿明年度报告，一起揭晓「我的答案自白」~
在疫情频发的一年里，我们迎难而上拥有了有机酸靶向代谢组、极微量单细胞蛋白质组学、高通量单细胞蛋白质组、类固醇激素（动物激素）靶向代谢检测、超微量蛋白质组学之组织样本/切片类样本，怀抱“以生物科技，成就他人，造福大众”的使命，发表了数百篇文章、处理了十几万份样本。今天给大家总结年最具看点的10佳文章~希望在年能给各位科研老师带来一些帮助！！！
哈医大一院姚丽芬组支链氨基酸缓解帕金森小鼠发病机制研究
肠道菌群衍生物支链氨基酸在帕金森病发病机制中的作用：动物研究
研究对象：小鼠
发表期刊：BrainBehaviorandImmunity
影响因子：19.
发表时间：年09月
合作单位：哈尔滨医院
运用组学技术：气相色谱-质谱法、免疫学、GC-MS靶向代谢组学、16SrRNA基因测序
研究思路：
研究结论：
本篇研究，首次揭示了高BCAAs饮食对鱼藤酮诱导的PD小鼠的保护作用，同时表征了不同时间鱼藤酮诱导小鼠的肠道微生物组，并鉴定了与PD进展相关的微生物标志物。通过靶向代谢组学也确定了血清中BCAAs水平的降低。说明肠道微生物群及其代谢产物的失调在PD发病机制中的重要性，表明高剂量补充BCAAs可能是治疗PD的新方向，但需要深入探究BCAAs在PD中的可能机制。
西北研究院刘光琇团队探索新型tRNA增产抗生素
一种新的细菌tRNA通过规避低效的摆动碱基配对提高链霉菌的抗生素产量
研究对象：链霉菌
发表期刊：NucleicAcidsResearch
影响因子：19.16
发表时间：年5月30日
运用组学技术：iTRAQ蛋白质组学
研究思路：
研究结论：
本文鉴定并证明了一种新型细菌tRNA的功能。这种tRNA的表达否定了依赖于链霉菌中摆动碱基配对的低效率翻译的要求，从而导致本研究检测到的所有抗生素产量增加，并为基因表达和抗生素生物合成的调节建立了新的范例。数据表明以这种方式控制链霉菌中的翻译效率不仅可以提高已知抗生素的产量，而且还可以提高天蓝色链霉菌另外一种抗生素的表达。这是一种合理且相对简单的通用策略，可以提高翻译效率的多效性，可以纳入未来抗生素的发现计划。
16S+代谢组学如何“步步为营”探究植物生长奥秘？
植物根际微生物对开花时间影响的研究
研究对象：野生型和突变型拟南芥根系分泌物、根际土壤
发表期刊：Microbiome
影响因子：14.
运用组学关键技术：微生物16srRNA测序、代谢组学
研究思路:
研究结论：
了解根际微生物的群落/功能关系以及与植物生理学相互作用对确定植物微生物组在调节生物地球化学循环、植物生长和物候学中的作用至关重要。作者确定了一个新的代谢网络，发现分泌物影响植物的根际微生物群，然后通过产生IAA来调节开花时间，还可通过调节氮利用来影响营养生长。IAA促进植物生长也进一步刺激分泌物渗出，并因此以积极的反馈机制影响开花时间。
揭示新冠肺炎患者血糖异常升高的新机制及潜在的治疗靶标
GP73是一种促成糖激素，会导致严重急性呼吸综合征冠状病毒诱导的高血糖
研究对象：小鼠
期刊：NatureMetabolism
影响因子：13.
发表时间：年1月6日
发表单位：医院生物工程研究所
运用组学技术：磷酸化蛋白质组学、LC-MS靶向代谢组学
研究思路：
1、前期建模实验：
2、后期实验验证：
研究结论：
该研究发现了一个全新的糖异生调控激素——GP73，新冠病毒感染会诱导GP73的产生和分泌，从而导致过度的糖异生。持续升高的GP73可能直接使宿主发生糖代谢异常，利用抗体阻断循环系统中的GP73，则有可能减轻新冠感染期和恢复期的血糖异常和病死率。
运用DIA蛋白组技术探究机械刺激介导肌腱发育机制
机械刺激和波浪形结构的协同效应刺激肌腱工程的天然胶原蛋白发育
研究对象：大鼠
期刊：ActaBiomaterialia
影响因子：10.
发表时间：年6月
发表单位：上海交通大学医医院整复外科
运用组学技术：DIA定量蛋白质组学
研究思路：
研究结果：
本文通过建立酸中毒耐受的PDAC细胞模型，作者使用非靶向代谢组学发现随着细胞内葡萄糖的增加，糖酵解减少，戊糖磷酸途径(PPP)代谢发生转变；并同时联合芯片转录组技术，发现这转变过程中关键基因MMP1和Hippo信号传导基因表达谱的变化特征。同时，DIA定量蛋白组学技术平台确定和验证机械剥夺模型中调节的关键的分子和通路途径，用于揭示了力学介导的肌腱胶原蛋白发育过程。
功能代谢组学揭示胰腺癌新治疗靶点
功能代谢组学揭示了cAMP-AMP轴的双激活是胰腺癌的一个新的治疗靶点
研究对象：胰腺癌肿瘤组织、人胰腺细胞
期刊：PharmacologicalResearch
影响因子：10.
发表单位：上海交通大学
运用组学技术：TMT标记定量蛋白质组学、空间代谢组学、转录组测序
研究推荐：
胰腺癌(Pancreaticcancer,PC)具有极高的侵袭性和死亡率，是恶性的癌症之一。然而，这种情况目前引起广泛的耐药和治疗不足。在这项研究中，作者提出了一种新的功能代谢组学策略，即空间-时间操作的代谢组学(STORM)，以动态和可视化的模式识别决定性功能代谢产物，其水平变化及其对PC的治疗效率有机制关联。
本文结合体内功能代谢产物的定量分析和空间可视化表征，作者确定AMP-cAMP轴是PC的一个新的治疗靶点。综上所述，作者提出STORM新策略首次从代谢角度确定了PC的新靶点，验证诱导AMP-cAMP轴的双激活可以有效抑制PC肿瘤的生长。此外，该发现能够通过与新靶点的特异性相互作用降低耐药性，有助于提高治疗效率。本文运用了TMT标记蛋白组学、空间代谢组学、转录组测序等组学技术方法做了深入探究。
探究银纳米离子对水稻代谢谱、产量、土壤微生物群落的影响
水稻暴露于银纳米粒子的生命周期研究:剂量反应对谷物代谢谱、产量和土壤细菌的影响
研究对象：水稻
期刊：EnvironmentalScienceNano
影响因子：9.
发表时间：年4月29日
运用组学技术：微生物16srRNA测序、GC-MS非靶向代谢组学
研究思路：
研究结论：
由于银纳米颗粒或银离子引发的活性氧，银纳米颗粒长期以来似乎对植物有毒，诱导氧化应激，影响光合速率，并抑制植物生长。然而，本文章研究的农业非点源污染对水稻及其土壤微生物群落的结果表明，1mg/kg的AgNPs促进水稻分蘖，从而提高产量。相反，10mg/kg的AgNPs显著降低水稻产量和生物量。在评估剂量下，银不会在大米(精米)的可食用组织中积累，表明对食品安全和人类健康的风险可能较低。
探究肠道-睾丸轴：肠道菌群可改善精子质量
肠-睾丸轴:微生物群主要代谢组提高年轻Ⅱ型糖尿病人的精子质量
研究对象：小鼠粪便、小鼠血浆、小鼠睾丸组织
期刊：MicrobiologySpectrum
影响因子：9.
发表时间：年9月20日
运用组学技术：LC-MS非靶向代谢组、转录组测序、16srRNA测序
研究思路：
研究结论：
研究结果强烈表明有必要探索微生物群粪便移植疗法，以降低在T2D病程早期的青年男性不育症的升高率。此外，有必要对患有T2D的青年进行临床研究，以阐明有益微生物群在改善精液质量和男性生育能力中的作用。
运用多组学技术揭示剖宫产瘢痕憩室中宫颈微生物群与宿主基因调控的相互作用
剖宫产瘢痕憩室中宫颈微生物群与宿主基因调控的相互作用
研究对象：人
期刊：MicrobiologySpectrum
影响因子：9.
发表时间：年07月28日
合作单位：医院
运用组学技术：微生物组、转录组、代谢组
研究思路：
研究结论：
本研究试图从多个角度解释宫颈微生物群和代谢物对CSD女性的影响，包括微生物角度和人类宿主反应角度。作者观察到，CSD组宫颈菌群结构与对照组不同。CSD组乳酸菌明显减少，而潜在有害菌种的比例和丰度增加。乳酸杆菌的优势与阴道健康有关，该属的消耗可导致许多不利条件。在共现网络中，作者发现乳酸杆菌与三种潜在的致病细菌之间存在相互排斥的关系，很可能是CSD组中乳酸杆菌减少的重要机制。
运用多组学技术解析人参固本口服液通过多靶点实现对甲状腺毒症小鼠的抗衰老作用
人参固本对甲状腺素毒症小鼠的抗衰老作用：改善免疫衰老、低蛋白血症、脂毒性和肠道菌群
研究对象：小鼠
期刊：FrontiersinImmunology
影响因子：8.
发表时间：年10月25日
合作单位：鲁南制药集团，医院
运用组学技术：流式细胞技术、蛋白质组学，粪便代谢物学、植物代谢组学和微生物组学
研究思路：
研究结论：
本研究验证了RSGB对甲状腺毒症小鼠的抗衰老作用，并阐明了其作用机制和物质基础。除了通过测试血液指标获得的抗衰老效果外，鉴于RSGB成分的多重保护作用，推测RSGB可能还具有器官保护作用，接下来的研究将验证器官保护作用，以更充分地证明RSGB的抗衰老作用。长期以来，中医药多要素、多效的系统治疗策略为保障国人健康发挥了重要作用，相信随着对中医药的不断研究和认识，未来在保障全球人类健康方面也将发挥更大的作用。
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